55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0170 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  37.94 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  32.92 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  32.51 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  30.69 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  30.47 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  32.41 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  30.22 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  28.97 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  28.97 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  26.88 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  24.1 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  30.37 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.22 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  22.51 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  25.62 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  24.75 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  25.85 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  25.51 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  21.86 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  24.67 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  26.64 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  25.31 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  22.03 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  23.43 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  22.84 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  21.48 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  22.78 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  21.95 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  21.31 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  19.62 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  24.75 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  24.5 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  23.26 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  22.73 
 
 		 462 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  23.36 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.32 
 
 		 395 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  22.42 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  23.1 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  23.08 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  22.48 
 
 		 561 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  22.77 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  27.84 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  21.21 
 
 		 392 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  20.69 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  20.88 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  23.79 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  25.63 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  22.55 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  19.72 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  19.72 
 
 		 275 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>