51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1736 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  52.1 
 
 		 315 aa  348  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  51.64 
 
 		 312 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  53.42 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  50.64 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  36.97 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  34.42 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  31.03 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  30.89 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  28.92 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  28.02 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  28.62 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.82 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  31.25 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  28.85 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  27.71 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  29.84 
 
 		 258 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  29.63 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.18 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  25.28 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  26.32 
 
 		 282 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  25.44 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  25.9 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  25.97 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  25.76 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  28.64 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.1 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  25.1 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  23.33 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  23.85 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  23.99 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  24.09 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.67 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  27.34 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  23.36 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.31 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  22.42 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  25.56 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.36 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.79 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  26.16 
 
 		 400 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  22.36 
 
 		 553 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  24.53 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  24.17 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  26.09 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  23.93 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.27 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  24.02 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  25.77 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  24.41 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>