299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3354 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  89.67 
 
 		 426 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 426 aa  877    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  32.94 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  30.39 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  32.5 
 
 		 292 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  29.31 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.79 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  33.94 
 
 		 282 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  27.99 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  35.65 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.63 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  36.47 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  29.82 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  37.04 
 
 		 282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.2 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  39.11 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  34.8 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  29.14 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  30.15 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  31.37 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  37.5 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  34.63 
 
 		 291 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  29.73 
 
 		 284 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  97.1  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  29.17 
 
 		 262 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  25.07 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.53 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  30.62 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  27.08 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  29.38 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  29.25 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  29.49 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  29.05 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  25.94 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  30.7 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  29.44 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  29.59 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  25 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  31.55 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  24.91 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  29.38 
 
 		 285 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  28.57 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  23.21 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  27 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  29.82 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.08 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  32.45 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  32.45 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  29.17 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.93 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  31.79 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  26.87 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  31.82 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  27.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  40 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  27.72 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  29.94 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  24.81 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  28.57 
 
 		 474 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  24.81 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  26.99 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  23.62 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  27.16 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  24.81 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  38.57 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  28.26 
 
 		 308 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  37.84 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  33.8 
 
 		 539 aa  54.3  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.17 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  27.95 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  27.95 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  27.95 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  27.95 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  27.95 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  37.17 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  36.28 
 
 		 456 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  31.43 
 
 		 464 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 523 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>