51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0118 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  55.92 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  48.78 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  44.89 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  43.54 
 
 		 293 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  44.31 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  41.48 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  45.53 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  45.12 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  48.37 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  43.25 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  34.27 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  30.22 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  26.61 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  29.69 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  32.99 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  30.6 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  28.95 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  30 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  24.57 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  29.61 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  25.22 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  25.56 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  26.25 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  25.65 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  24.67 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  25 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.21 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  27.14 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  25.21 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.71 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  27.27 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  26.79 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  22.43 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  23.88 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25.82 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  23.18 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  24.51 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  23.29 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  29.05 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  22.75 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  22.64 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  24.17 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  28.86 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  22.4 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  21.13 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  23.2 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  21.79 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  28.71 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.41 
 
 		 392 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>