53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3469 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  52.54 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  53.82 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  47.89 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  45.8 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  46.32 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  46.37 
 
 		 294 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  45.96 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  49.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  45.21 
 
 		 295 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  36.44 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  28.06 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  28.82 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.08 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  29.22 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  30.74 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  28.67 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  29.96 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  27.76 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  28.35 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  26.62 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  28.38 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  28.99 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  28.8 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  28.69 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  27.93 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28.45 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  29.17 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  24.04 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  28.7 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  27.91 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  24.24 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  24.41 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25.96 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  27.05 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  26.16 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  27.05 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  23.67 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  21.97 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  23.96 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  25.42 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.48 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  21.55 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.43 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  20.99 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  22.9 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  25 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  23.86 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  21.21 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>