53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0610 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  59.32 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  52.92 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  52.99 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  51.98 
 
 		 274 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  48.75 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  50.82 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  43.34 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  46.51 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  37.76 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  37.15 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  36.4 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  36.59 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  34.94 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  33.7 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  33.72 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  32.31 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  31.76 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  32.86 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  32.67 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  35.27 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  30.74 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  32.85 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  32.85 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  29.61 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  30.63 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  29.43 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  30.21 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  25.67 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  26.07 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  31.38 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  26.24 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.7 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  21.32 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.38 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  30.28 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  24.82 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  25.29 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  27.6 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  24.81 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  23.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  22.22 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  26.05 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  24.77 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  26.37 
 
 		 462 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.06 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  28.47 
 
 		 561 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  24.64 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>