56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2977 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  55.51 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  53.53 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  52.7 
 
 		 275 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  49.41 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  37.31 
 
 		 322 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  38.4 
 
 		 359 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  39.47 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  39.08 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  40.82 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  34.92 
 
 		 278 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  35.27 
 
 		 314 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.65 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  38.61 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  29.39 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  31.36 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  26.91 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  30.68 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  32.4 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  29.6 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  33.47 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  26.88 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  30.35 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  32.81 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  30.38 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  25.68 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  29.77 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  26.85 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  32.26 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  30.28 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  30.38 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  27.14 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  32.91 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  31.6 
 
 		 436 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  24.29 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.63 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  27.93 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  28.37 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22.22 
 
 		 282 aa  52  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.05 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  28.24 
 
 		 376 aa  48.9  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  23.96 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  33.62 
 
 		 561 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  25.12 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  25.11 
 
 		 426 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.55 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  30.41 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  25.11 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.51 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  24.19 
 
 		 283 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  23.94 
 
 		 284 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>