44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0707 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  60.4 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  52.34 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  48.35 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  55.04 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  57.75 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  49.8 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  53.81 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  49.21 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  43.06 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  32.56 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  32.11 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  31.86 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  32.46 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  28.34 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  33.05 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  30.89 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  30.83 
 
 		 345 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  30.65 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  29.23 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  33.99 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  26.09 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  33.5 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  32.03 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  28.22 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  35.45 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.48 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  20.8 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  25.98 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  26.26 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  30.2 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25.52 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  25.52 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.38 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  21.46 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  21.7 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  29.88 
 
 		 462 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  38.2 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>