55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0298 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  65.43 
 
 
293 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  55.88 
 
 
256 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  53.23 
 
 
314 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  50.43 
 
 
274 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  53.81 
 
 
302 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  46.52 
 
 
291 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  44.89 
 
 
305 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  46.27 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  41.57 
 
 
302 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  36.11 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  35.95 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  36.21 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  36.58 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  31.64 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  36.4 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  35.1 
 
 
294 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  31.25 
 
 
359 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  31.1 
 
 
345 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  34.57 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  29.13 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  31.6 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  32.76 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  31.43 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  31.43 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  27.86 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  27.91 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  29.58 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  27.95 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  30.12 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.62 
 
 
282 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  25.36 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  28.92 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  26 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25.42 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  22.46 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  26.29 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  21.76 
 
 
280 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  26.91 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  22.17 
 
 
282 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  27.36 
 
 
390 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  23.96 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  24.53 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  25.62 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  26.25 
 
 
392 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.58 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  40 
 
 
376 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.7 
 
 
454 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  27.41 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  23.04 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  23.48 
 
 
426 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>