71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0135 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  898    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  40.04 
 
 		 462 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  39.47 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  35.03 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  35.56 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  29.11 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.34 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  26.85 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.58 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  27.38 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  28.3 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  28.36 
 
 		 292 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  24.59 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  24.59 
 
 		 426 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  27.34 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  40.14 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  33.83 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.55 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  21.43 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  26.47 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.9 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  27.41 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  36.17 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  26.43 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  33.1 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  31.67 
 
 		 282 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  34.38 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.75 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  23.86 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  27.86 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  25.89 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  30 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  31.67 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  22.36 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  26.92 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  26.94 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  30.56 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  27.66 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  22.97 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  31.82 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  31.09 
 
 		 553 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  31.11 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2395  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.67 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00219283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.64 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  46.88 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  25 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  28.29 
 
 		 285 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  45.31 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  45.31 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.28 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  38.24 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0448  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.39 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  23.33 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  33.06 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  32.56 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  25.64 
 
 		 275 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.94 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.66 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.62 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  30.51 
 
 		 250 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  43.86 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  34.18 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  38.1 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  32.47 
 
 		 470 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  26.81 
 
 		 278 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.75 
 
 		 312 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  29.55 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>