96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0461 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 392 aa  798    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  36.92 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  34.79 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.03 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  32.05 
 
 		 561 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  29.94 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29.63 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  26.72 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.16 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.39 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  28.74 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  26.27 
 
 		 376 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  28.63 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.37 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  26.34 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  30.92 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  24.36 
 
 		 244 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  28.63 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  29.9 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.14 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  31.25 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  29.06 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  29.15 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  28 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  27.95 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  24.82 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.21 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  28.02 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  25.63 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  31.33 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.74 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  25.87 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  22.42 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  25.37 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  23.66 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  27.73 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  29.28 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  27.76 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  23.36 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  27.48 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  24.19 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  25.15 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  24.25 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  25.68 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  25.45 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  29.07 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  30.05 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  26.48 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  26.56 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  27.2 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  26.84 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  25.32 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  25.35 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  23.2 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  26.53 
 
 		 283 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 		 503 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  24.89 
 
 		 297 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0175  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.87 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.223936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.19 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  35.53 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  21.9 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  34.57 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  28.26 
 
 		 275 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  31.97 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  44.44 
 
 		 504 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  50 
 
 		 503 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  41.79 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  37.5 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  28.26 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  30.26 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  26.92 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.88 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  22.98 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  33.77 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  36.23 
 
 		 674 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  45.24 
 
 		 598 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  31.65 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0249274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  46.34 
 
 		 514 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  37.5 
 
 		 504 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  29.41 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  30.43 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  27.82 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.11 
 
 		 485 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.11 
 
 		 461 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  33.33 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  23.88 
 
 		 284 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>