62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0534 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 282 aa  590  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  91.84 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  51.35 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  51.76 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  41.18 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  42.12 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  39.08 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  39.57 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  39.58 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  37.45 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  36.33 
 
 		 292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  36.47 
 
 		 426 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  37.04 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  34.88 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  30.65 
 
 		 392 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  30.23 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  33.6 
 
 		 376 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  28.93 
 
 		 390 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  28.35 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  28.77 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  28.71 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  29.52 
 
 		 411 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  28.14 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  27.95 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  29.66 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.91 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.82 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  26.76 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  28.4 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  25.21 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  25.1 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  25.37 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  29.22 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  33.77 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  26.88 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25.28 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.67 
 
 		 454 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  26.36 
 
 		 553 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  31.03 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  26.59 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  24.72 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  26.47 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  26.17 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  27.2 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  25.63 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  25.62 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  30.97 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  32.03 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.25 
 
 		 395 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  25.19 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  28.37 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  24.49 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.21 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  27.05 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.26 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  24.39 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  22.75 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  26.42 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  23.26 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  29.11 
 
 		 282 aa  42  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>