58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1026 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  40.94 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  33.94 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  32.42 
 
 		 325 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  30.65 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  35.29 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  34.32 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  31.38 
 
 		 345 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  31.97 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  29.67 
 
 		 310 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  29.84 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  29.63 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29.49 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  31.05 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  27.19 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25.2 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.31 
 
 		 386 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  24 
 
 		 400 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  25.98 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  23.26 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  25.23 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  22.79 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  25.7 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.52 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  28.1 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.19 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  24.62 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  30.97 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  37.74 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.34 
 
 		 395 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.38 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  26.47 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  24.78 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.73 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  25.54 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  31 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  27.75 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  26.58 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  26.27 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  27.31 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  27.68 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  23.74 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  26.32 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  25.68 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  22.89 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  29.53 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  22.03 
 
 		 411 aa  45.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  24.79 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  26.77 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  26.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.37 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  32.26 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.7 
 
 		 454 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  25.65 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>