209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0907 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 426 aa  880    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  89.67 
 
 		 426 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  29.46 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  33.14 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  28.35 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  36.49 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.14 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  34.39 
 
 		 282 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  28.16 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  37.04 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  37.04 
 
 		 282 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.93 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.16 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  34.16 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.81 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  28.95 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  28.95 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  28.15 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  31.23 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  38.12 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  31.51 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  30.98 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  31.25 
 
 		 309 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  30.73 
 
 		 284 aa  97.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  36.18 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  29.17 
 
 		 262 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  28 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  32.9 
 
 		 291 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.59 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  24.06 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  26.94 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  29.94 
 
 		 561 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  27.67 
 
 		 310 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  29.5 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  29.21 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  27.13 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  24.37 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  29.08 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  27.19 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  28.76 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  30.36 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  27.8 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  25.21 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  29.76 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  26 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  28.81 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  29.76 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  28.57 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.47 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  25.66 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  29.68 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  26.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.49 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  29.03 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  29.75 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  29.93 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  28.07 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  25.12 
 
 		 293 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  29.17 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.49 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  40 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  38.03 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  40 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  38.27 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  37.84 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.06 
 
 		 523 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  26.73 
 
 		 345 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 		 342 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  31.37 
 
 		 464 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  28.57 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  27.05 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  28.57 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  28.57 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  38.57 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  28.57 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  31.17 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  28.57 
 
 		 478 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  35.35 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  39.47 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  28.21 
 
 		 539 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>