71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2382 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
436 aa  895    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  50.7 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  43.09 
 
 
386 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  41.3 
 
 
376 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.83 
 
 
395 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  34.23 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  29.74 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  33.33 
 
 
292 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  30.77 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29.31 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  35.22 
 
 
285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28.16 
 
 
426 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  33.05 
 
 
288 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  32.62 
 
 
282 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  28.74 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  30.23 
 
 
282 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  30.23 
 
 
282 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  27.94 
 
 
284 aa  106  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  28.21 
 
 
262 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  30.6 
 
 
553 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.61 
 
 
411 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  35.27 
 
 
269 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  30.46 
 
 
561 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.02 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  34.58 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  31.75 
 
 
280 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  23.35 
 
 
244 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  25.76 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  36.89 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25.22 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  25.32 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  28.74 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  33.09 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  24.77 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  28.23 
 
 
294 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  26.32 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  26.44 
 
 
315 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28.52 
 
 
322 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  27.72 
 
 
294 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  26.03 
 
 
310 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  30.57 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  28.05 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  31.29 
 
 
368 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  27.14 
 
 
258 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  27.51 
 
 
294 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  23.86 
 
 
325 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  29.91 
 
 
345 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  27.4 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  29.44 
 
 
359 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  31.6 
 
 
250 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  31.7 
 
 
275 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  29.46 
 
 
283 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  29.18 
 
 
278 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  28.84 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  26.64 
 
 
293 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  29.47 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  30.33 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.56 
 
 
476 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  27.67 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38 
 
 
523 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  29.05 
 
 
342 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  27.2 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  28.95 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.36 
 
 
282 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.25 
 
 
537 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  28.24 
 
 
293 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  23.79 
 
 
283 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  30.43 
 
 
511 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3697  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.44 
 
 
187 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271638  normal  0.168609 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  26 
 
 
471 aa  43.1  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>