67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1114 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  46.04 
 
 
282 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  44.69 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  41.25 
 
 
288 aa  221  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  39.57 
 
 
282 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  40.91 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  38.72 
 
 
269 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  36.61 
 
 
284 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  35.5 
 
 
280 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  35.55 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  35.66 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  33.81 
 
 
392 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  36.87 
 
 
400 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  35.22 
 
 
436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  34.16 
 
 
426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  34.8 
 
 
426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  34.21 
 
 
411 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  32.47 
 
 
376 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  32.17 
 
 
386 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  31.61 
 
 
244 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  29.25 
 
 
390 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.47 
 
 
395 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  30.22 
 
 
553 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  27.18 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  26 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  28 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  24.39 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  26.7 
 
 
315 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  30.08 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  30.2 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  27 
 
 
561 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.46 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  29.38 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  27.38 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  27.81 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  24 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  34.07 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  27.98 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  28.96 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  27.45 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  26.04 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.86 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  25.55 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  25.2 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  26.04 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  25.46 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  22.78 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  25.51 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  25.43 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  23.28 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  25.32 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  22.99 
 
 
359 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.5 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  25.82 
 
 
283 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  25.12 
 
 
256 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  24.89 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  30.6 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  26.96 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  27.05 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  26.69 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  26.32 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  26.83 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  24.05 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  27.66 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  24.87 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  25.25 
 
 
293 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  28.5 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>