132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1083 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 386 aa  765    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  46.36 
 
 		 376 aa  296  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  43.09 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  43.47 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.17 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  33.62 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  32.32 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  32.09 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29.79 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  32.61 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.14 
 
 		 426 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  32.17 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  29.05 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  27.55 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.58 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  27.51 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  32.26 
 
 		 282 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  33.68 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  29.88 
 
 		 288 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  27.93 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  31.02 
 
 		 282 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  26.34 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  30.63 
 
 		 262 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  37.58 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  33.2 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  27.02 
 
 		 325 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  32.2 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  27.78 
 
 		 244 aa  89.7  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  28.26 
 
 		 284 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  27.91 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  26.88 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  34.06 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  33.5 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  24.77 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  33.47 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  26.2 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  33.06 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  27.31 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  30.67 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  30.35 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  30.8 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  27.21 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  30.09 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  29.2 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  30.24 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  28.92 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  29.96 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  21.48 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  30.43 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  30.58 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  36.52 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.68 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  30.58 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  30.86 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  26.43 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  44.44 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  39.68 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  22.88 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2349  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.14 
 
 		 943 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.33 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  30.85 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  34.15 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  38.71 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  40 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.68 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.71 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  38.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  34.92 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.72 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.72 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.1 
 
 		 496 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  30.88 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.89 
 
 		 503 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  31.94 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  41.46 
 
 		 451 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  39.34 
 
 		 516 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.29 
 
 		 487 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  29.41 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  29.06 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  27.43 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  29.41 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  35.38 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  25.66 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  38.75 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  43.33 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  36.07 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>