68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4797 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  61.18 
 
 		 295 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  56.04 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  54.98 
 
 		 294 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  59.18 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  54.79 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  54.45 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  52.56 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  53.26 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  51.22 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  48.37 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  24.81 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  36.05 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  33.1 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  26.88 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  32.27 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  31.67 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  31.67 
 
 		 345 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  34.29 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  31.9 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  31.67 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  31.4 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  32.78 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  29.8 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  30.61 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  31.58 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  29.47 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  31.13 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  31.27 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  29.02 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  29.15 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  29.88 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  24.5 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.61 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  24.34 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  25.81 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  27.84 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  24.06 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  28.93 
 
 		 411 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  26.24 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  22.89 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  26.09 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.16 
 
 		 426 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.93 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.84 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  24.91 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  30.08 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  25.09 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  24.6 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  23.55 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  30.63 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  27.82 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  28.26 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  31.48 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  31.06 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.66 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  37.5 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  29.05 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  32.19 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  24.9 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.15 
 
 		 400 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>