50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0868 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  100 
 
 		 312 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  62.58 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  62.38 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  56.73 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  51.79 
 
 		 309 aa  351  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  35.07 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  33.98 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  33.74 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  30.37 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  29.64 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  31.88 
 
 		 426 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  28.86 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  29.27 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.1 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.51 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  26.95 
 
 		 392 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.2 
 
 		 400 aa  99.4  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  27.92 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  28.48 
 
 		 376 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  30.54 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  26.86 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  27.48 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  25.62 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  23.02 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  24.22 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.21 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  25.32 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.6 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  24.31 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.81 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  24.9 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  22.51 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  24.38 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  21.5 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  26.6 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  25.72 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  28.12 
 
 		 561 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.01 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  26.75 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  24.44 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  23.79 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  21.07 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  23.83 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  24.39 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  22.95 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  23.39 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  24.83 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>