52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0600 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  98.55 
 
 		 275 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  81.99 
 
 		 275 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  54.1 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  51.99 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  41.57 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  40.62 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  38.81 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  39.69 
 
 		 342 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  37.74 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  34.39 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  32.95 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  37.37 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  34.25 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.36 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  34.25 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  32.54 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  31.47 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  30.12 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  29.32 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  29.73 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  29.81 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  32.45 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  30.89 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  31.84 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  30.91 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  28.89 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  33 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  28.9 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  28.26 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  30.29 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  26.34 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  28.3 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  25.47 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  20.52 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  20.92 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  29.12 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.27 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  26.6 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  28.95 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  24.27 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.75 
 
 		 454 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.36 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  22.94 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  22.99 
 
 		 262 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>