42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43594 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  100 
 
 
553 aa  1139    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  33.46 
 
 
292 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  30.6 
 
 
436 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  29.46 
 
 
411 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  26.72 
 
 
392 aa  94.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  27.55 
 
 
282 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  30.22 
 
 
285 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  25.42 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  30.77 
 
 
392 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  27.14 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  25.86 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  27 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  27.24 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  33.79 
 
 
462 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  22.58 
 
 
244 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  28.05 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  26.2 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  35.83 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.8 
 
 
376 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  25.2 
 
 
262 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  27.82 
 
 
561 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  24.37 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  22.81 
 
 
325 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  26.47 
 
 
282 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  24.66 
 
 
288 aa  64.3  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  22.36 
 
 
315 aa  63.9  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  24.88 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45385  predicted protein  23.21 
 
 
462 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  23.21 
 
 
426 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  22.06 
 
 
315 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  28.7 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  28.7 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.09 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  28.7 
 
 
342 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  22.38 
 
 
309 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  21.43 
 
 
312 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  22.36 
 
 
345 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  24.47 
 
 
291 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.47 
 
 
395 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  30.69 
 
 
294 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  28.45 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>