71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3583 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  66.55 
 
 		 293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  41.36 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  34.65 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  34.34 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  34.38 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  33.86 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  32.97 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  31.76 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  34.92 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  32.95 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  31.52 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  31.13 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  30.59 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  30.65 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  29.88 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  31.73 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  29.63 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  32.02 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  37.04 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  32.02 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  29.22 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.73 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.32 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  30.93 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  28.14 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  29.26 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  28.96 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  28.44 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  31.43 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  27.14 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  28.43 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  22.03 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  26.12 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.67 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  25.89 
 
 		 411 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  25.56 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  33.18 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  26.56 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  25.45 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  33.08 
 
 		 561 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.27 
 
 		 376 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  29.18 
 
 		 436 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  28.36 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  25.28 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  27.05 
 
 		 426 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  32.33 
 
 		 462 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  26.42 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  25 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  23.98 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  30.45 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  24.68 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  24.6 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  24.43 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  30 
 
 		 345 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  20.93 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  27.42 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  22.96 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.81 
 
 		 454 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  21.72 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25.53 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  25.12 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  23.26 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  22.83 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>