57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  83.56 
 
 		 293 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  60.96 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  58.42 
 
 		 294 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  56.01 
 
 		 294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  55.67 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  56.99 
 
 		 295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  56.23 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  52.56 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  50.39 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  41.48 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  30.63 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  37.94 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  30.89 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  33.99 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  36.43 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  33.56 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  34.01 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  33.44 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  33.33 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  36.62 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  32.42 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  36.58 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  33.07 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  32.9 
 
 		 368 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  31.51 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  32.53 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  31.46 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  33.33 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  32.92 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  28.63 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  32.33 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  29.27 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  31.47 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28.76 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  26.04 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  28.26 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  28.92 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  29.77 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  30.58 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  24.81 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  24.6 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  29.03 
 
 		 411 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  26.15 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  25.32 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  24.14 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  34.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  25.29 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  27.13 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  24.54 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  33.82 
 
 		 400 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  27.2 
 
 		 436 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  29.25 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>