52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1104 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  54.06 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  57.03 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  45.52 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  47.04 
 
 		 314 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  52.86 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  41.52 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  49.61 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  44.35 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  39.41 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  30.92 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  30.72 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  31.05 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  30.93 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  34.82 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  29.63 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  31.16 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  32.73 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  33.2 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  33.06 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  36 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  33.2 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  34.05 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  29.6 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  30.82 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  32.88 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  31.58 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  24.67 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  24.54 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22.82 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  29.12 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  26.82 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.12 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  31.68 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  25.43 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  25.61 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  26.86 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  30.52 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  28.29 
 
 		 426 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  26.61 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  26.19 
 
 		 386 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  27.22 
 
 		 462 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  27.27 
 
 		 392 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  24.5 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  26.32 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  25.23 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.64 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  22.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>