42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0430 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  91.43 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  58.85 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  52.59 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  59.35 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  46.21 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  53.63 
 
 		 274 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  47.06 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  46.27 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  39.48 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  31.71 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  33.77 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  33.85 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  33.98 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  34.38 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  34.12 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  33.19 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  33.91 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  35.43 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  33.6 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  31.3 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  36.27 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  29.24 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  36.27 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  33.99 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  29.17 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  36.99 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  24.11 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  26.79 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  29.85 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  29.46 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.5 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  26.16 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  30.31 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  28.28 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  28.5 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  32.76 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  37.08 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  25.81 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.62 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>