40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0421 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 305 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  91.43 
 
 		 284 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  58.44 
 
 		 291 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  51.95 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  58.61 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  45.88 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  53.95 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  44.14 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  45.8 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  37.33 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  33.96 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  34.76 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  33.46 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  32.54 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  33.62 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  32.68 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  34.48 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  33.86 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  35.04 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  33.59 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  32.31 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  35.78 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  35.78 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  30.31 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  33.46 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28.73 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  28.79 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  35 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.07 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  23.43 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  29.17 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  26.46 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22.22 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.73 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  25.76 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  30.26 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.19 
 
 		 392 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  28.24 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>