49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2390 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  34.27 
 
 		 283 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  36.44 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  40.41 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  39.78 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  37.94 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  37.86 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  35.25 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  37.04 
 
 		 295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  37.45 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  35.95 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  36.05 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  25.31 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  36.44 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  24.1 
 
 		 283 aa  95.1  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  39 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  33.49 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  30.73 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  29.8 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  37.44 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  29.72 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  33.68 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  33.68 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  35.45 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  33.18 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  30.24 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  32.54 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  35.59 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.24 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  29.09 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.97 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  23.83 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  27.71 
 
 		 368 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  30.41 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  31.67 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  30.28 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  25.1 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  28.92 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  34.92 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  29.77 
 
 		 411 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  26.18 
 
 		 426 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.48 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  23.47 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  27.47 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  31.84 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  23.13 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  33.7 
 
 		 561 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  23.29 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>