137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1654 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1654  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  658    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1844  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.64 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.880462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  34.45 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  36.26 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  30.91 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  30.77 
 
 		 539 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.04 
 
 		 467 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  28.32 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 		 518 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.74 
 
 		 487 aa  50.8  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2466  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.28 
 
 		 556 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  29.91 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.7 
 
 		 569 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  27.36 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.86 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  33.33 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 376 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  33.05 
 
 		 412 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  30.84 
 
 		 578 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  30.84 
 
 		 588 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  29.66 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  34.78 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.54 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.82 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  29.31 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  34.41 
 
 		 496 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  38.81 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.74 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  34.41 
 
 		 496 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.74 
 
 		 459 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  28.95 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  29.63 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  32.26 
 
 		 502 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.57 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.26 
 
 		 504 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.76 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  34.41 
 
 		 508 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  35.48 
 
 		 496 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  24.82 
 
 		 409 aa  46.2  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  26.09 
 
 		 476 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  26.37 
 
 		 503 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  29.01 
 
 		 496 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.15 
 
 		 513 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  31.96 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.85 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  34.78 
 
 		 524 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  30.09 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  30.11 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  31.96 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  30.43 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  34.78 
 
 		 523 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  34.78 
 
 		 491 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  37.97 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  34.78 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  31.19 
 
 		 506 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  29.79 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  33.68 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  39.71 
 
 		 623 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.33 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  30.3 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  31.19 
 
 		 506 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  25.31 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  24.69 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  24.69 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  29.63 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.42 
 
 		 515 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  32.88 
 
 		 485 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  26.27 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  36.73 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  32.98 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  29.67 
 
 		 469 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  34.48 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  32.61 
 
 		 498 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  27.59 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.34 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  32.98 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  30.1 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  25.31 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  24.69 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  26.19 
 
 		 481 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.4 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  27.59 
 
 		 508 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  27.43 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  25.31 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  25.31 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  32.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  32.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  32.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  30.84 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>