More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0274 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 149 aa  309  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  98.66 
 
 		 149 aa  307  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  98.66 
 
 		 149 aa  307  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  91.28 
 
 		 149 aa  290  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  73.15 
 
 		 149 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  44.52 
 
 		 148 aa  143  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  42.95 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  42.57 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  41.61 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  41.5 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  47.65 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  48.28 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  40 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  34.01 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  38.93 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  40 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  39.33 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  35.51 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  34.07 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  39.29 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  33.09 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  35.94 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  37.32 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  36.81 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  32.62 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  36.36 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.34 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  30.66 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30.28 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  30.07 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  32.03 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  29.37 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  27.27 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  30.47 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  29.93 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  29.1 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  29.2 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  28.47 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  29.08 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  26.56 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  29.93 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  27.66 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  29.03 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  28.12 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  25.58 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  25.58 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  33.58 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  26.56 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  26.56 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  24.22 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  29.27 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  29.2 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  26.43 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  26.62 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>