290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1421 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  92.16 
 
 		 153 aa  286  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  89.54 
 
 		 153 aa  280  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  88.08 
 
 		 152 aa  277  3e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  61.97 
 
 		 162 aa  193  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  51.01 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  51.72 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  47.95 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  53.64 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  45.89 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  47.26 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  44.83 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  51.33 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  43.15 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  42.67 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  43.42 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  40.41 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  51.66 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  42.96 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  43.79 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  42.66 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  40.94 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  42.14 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  38.93 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  38.93 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  38.93 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  35.17 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  38.82 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  39.1 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  34.25 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  35.82 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.82 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  30.34 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  28.77 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  29.45 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  29.73 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  30.56 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  32.39 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  29.92 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  34.38 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  29.13 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  28.28 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  27.13 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  29.05 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  27.13 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  28.67 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  28.08 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  30.99 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  29.86 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  28.67 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  28.08 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  29.8 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>