More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2225 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  67.55 
 
 		 151 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  65.31 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  62 
 
 		 151 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  58.39 
 
 		 150 aa  189  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  54.42 
 
 		 162 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  53.57 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  51.75 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  52.74 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  49.31 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  51.43 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  49.65 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  51.01 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  47.26 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  46.21 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  46.31 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  46.9 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  46.98 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  36.91 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  35.21 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  37.78 
 
 		 194 aa  94  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  33.33 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  33.57 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  39.73 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.85 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  33.57 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  35.21 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  35.42 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  34.75 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  34.04 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  34.38 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  32.62 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  33.8 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  32.39 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  34.72 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  33.8 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  34.72 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  32.03 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  31.69 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0777  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  33.1 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4668  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  31.69 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4297  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000201851  unclonable  0.0000000000355605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04499  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.662464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0253  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0221  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224904  unclonable  0.0000000000165465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0216  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000313091  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0221  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000205657  unclonable  0.0000000000430972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3737  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1832  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000154353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>