More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0420 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  89.03 
 
 		 174 aa  284  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  80.85 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  73.25 
 
 		 174 aa  233  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  70.7 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  50 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  50 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  47.22 
 
 		 151 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  47.62 
 
 		 162 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  42 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  44.37 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  43.51 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  42.86 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  42.58 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  41.26 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  41.91 
 
 		 162 aa  111  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  38.41 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  36.96 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  35.86 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  40.14 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.56 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  37.76 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  37.04 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  35.66 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  40.26 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  31.85 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  34.96 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  35.38 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  33.57 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  30 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  35.38 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4254  ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589947  unclonable  0.00000000000214653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  29.5 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.21 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  30.83 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  26.81 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  33.08 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 120 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04499  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.662464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 129 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>