More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1247 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  58.39 
 
 		 153 aa  189  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  57.05 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  56.08 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  55.78 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  53.95 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  49.32 
 
 		 148 aa  159  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  50.71 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  45.64 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  48.57 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  46.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  47.97 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  45.52 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  43.15 
 
 		 153 aa  129  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  42.47 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  42.47 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  43.62 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  35.33 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  39.26 
 
 		 194 aa  98.2  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  36.96 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  34.31 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  37.9 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  36.72 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  34.33 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  33.33 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  32.09 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  31.03 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  30.56 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  29.85 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  29.85 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  32.09 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2303  30S ribosomal protein S13  29.55 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  32.09 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  28.79 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  32.09 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  29.45 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  29.85 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  29.1 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  28.79 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  29.1 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  28.47 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0350  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.10511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>