More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2589 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 178 aa  357  5e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  78.48 
 
 		 171 aa  253  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  74.52 
 
 		 176 aa  249  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  72.61 
 
 		 174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  66.88 
 
 		 174 aa  222  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  52.45 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  51.03 
 
 		 150 aa  156  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  48.25 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  47.55 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  44.9 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  44.37 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  46.1 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  43.36 
 
 		 153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  41.96 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  40.56 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  39.13 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  35.57 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  33.1 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  35.07 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  32.37 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  34.93 
 
 		 149 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 149 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 149 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  42.36 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  32.88 
 
 		 149 aa  91.3  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  32.86 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.85 
 
 		 144 aa  88.2  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  34.07 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  39.16 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  33.59 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  33.85 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3926  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  25.95 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  29.79 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  28.78 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  31.11 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5048  ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  28.03 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2304  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1044  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0395  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0403  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>