More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1618 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  55.33 
 
 		 162 aa  179  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  52.08 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  52.32 
 
 		 152 aa  158  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  53.79 
 
 		 153 aa  156  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  50 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  52.35 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  51.01 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  52.78 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  48.61 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  48.97 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  47.59 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  43.33 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  43.59 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  45.71 
 
 		 178 aa  130  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  44.29 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  42.57 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  42.57 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  42.57 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  43.45 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  43.54 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  49.34 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  44.76 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  38.62 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  42.86 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  40.71 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  38.89 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  42.54 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.81 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  41.89 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  34.65 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  36.11 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  34.01 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  30.14 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  30.14 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  31.72 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  31.03 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  25.87 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  29.17 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  31.58 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.94 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  30.83 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  29.86 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  30.61 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  32.09 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 116 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  28.12 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  32.31 
 
 		 123 aa  51.2  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 126 aa  51.2  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 129 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 124 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  31.34 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  27.82 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  29.1 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>