More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0056 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  91.8 
 
 		 122 aa  226  6e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  90.98 
 
 		 122 aa  226  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  91.74 
 
 		 121 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  91.74 
 
 		 121 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  90.91 
 
 		 121 aa  224  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  90.08 
 
 		 121 aa  221  3e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 127 aa  217  5e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  82.79 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  81.67 
 
 		 120 aa  201  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  160  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  157  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  157  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  65.52 
 
 		 127 aa  156  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  65.55 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  62.18 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  62.18 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  63.03 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  63.03 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.18 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  58.2 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  147  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  64.6 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  63.72 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  64.6 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 116 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  57.14 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 114 aa  141  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>