More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5763 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 125 aa  203  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 125 aa  202  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  75.2 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  72.8 
 
 		 124 aa  189  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  70.4 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  71.2 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  73.6 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  71.43 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  64 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  64 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  66.4 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  157  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  62.4 
 
 		 126 aa  157  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 116 aa  153  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  56 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  151  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  56 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  61.4 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>