More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0374 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 124 aa  250  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  81.45 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  83.06 
 
 		 124 aa  210  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  73.6 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  75.2 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  72 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  71.2 
 
 		 125 aa  181  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  70.4 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  170  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  170  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 121 aa  170  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  74.8 
 
 		 126 aa  169  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  165  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  68.07 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  59.5 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0341  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000179312  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4668  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  150  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4297  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000201851  unclonable  0.0000000000355605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1011  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000227796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0498  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5048  ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001720  SSU ribosomal protein S13p (S18e)  56.9 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000208001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  54.47 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 132 aa  146  7e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0235  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000771174  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  55.28 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4620  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000695624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3492  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3593  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00190616  normal  0.0522368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3781  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000117376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>