More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0866 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 126 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  71.2 
 
 		 125 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  67.46 
 
 		 126 aa  175  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  68.25 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  68.25 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  64 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  64 
 
 		 124 aa  166  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  63.71 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 124 aa  157  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  62.71 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.16 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 120 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  154  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  66.1 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  63.11 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 120 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  59.5 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  58.2 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  61.4 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>