More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0511 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 
122 aa  166  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  64.8 
 
 
126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 
122 aa  161  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 
124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 
122 aa  160  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 
127 aa  160  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  57.6 
 
 
126 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
124 aa  158  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
125 aa  158  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
126 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  62.4 
 
 
126 aa  156  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 
127 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  59.5 
 
 
121 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 
125 aa  155  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  60.8 
 
 
125 aa  155  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
125 aa  155  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 
124 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  60.8 
 
 
125 aa  154  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
123 aa  153  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
122 aa  153  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
124 aa  152  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
126 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
126 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
124 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 
123 aa  151  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  56 
 
 
125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  56.8 
 
 
126 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 
123 aa  150  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 
116 aa  150  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
122 aa  149  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
122 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
122 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
123 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 
123 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
125 aa  149  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  56.2 
 
 
124 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
119 aa  148  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 
118 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  56 
 
 
126 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
122 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 
122 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  55.28 
 
 
125 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 
126 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 
118 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  55.37 
 
 
122 aa  148  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
120 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 
125 aa  147  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
122 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3723  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0802348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3781  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2609  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3753  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3146  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.150463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1947  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.659033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 
122 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3501  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
121 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 
127 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 
118 aa  146  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2996  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 
121 aa  146  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  61.98 
 
 
122 aa  146  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3274  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000858241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  56 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3045  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2927  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 
121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0337  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 
121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220918  normal  0.0253305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3621  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101768  hitchhiker  0.00000000100437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  56.78 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2816  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162634  normal  0.184751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0290  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  54.03 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 
122 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  56 
 
 
125 aa  144  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 
126 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
122 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
124 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 
118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  59.32 
 
 
127 aa  144  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4297  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 
118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000201851  unclonable  0.0000000000355605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4668  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 
118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  56.1 
 
 
124 aa  143  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1011  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 
118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000227796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  56 
 
 
126 aa  143  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  56.52 
 
 
128 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55.08 
 
 
123 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>