More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1639 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  79.2 
 
 		 125 aa  206  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 125 aa  202  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  68.8 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  70.4 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  70.4 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  68.8 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 126 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  67.2 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  67.2 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  170  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  70 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  64.41 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  62.1 
 
 		 125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  58.73 
 
 		 126 aa  163  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  64.8 
 
 		 125 aa  162  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  65.52 
 
 		 127 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  61.11 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 124 aa  156  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  61.11 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  58.54 
 
 		 123 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  61.4 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  61.4 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 		 124 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  56.56 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3926  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5048  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  55.56 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>