More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1945 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 		 121 aa  208  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  82.64 
 
 		 121 aa  206  9e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  82.64 
 
 		 121 aa  206  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  81.82 
 
 		 121 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  82.79 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  81.97 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  81.97 
 
 		 122 aa  199  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  78.99 
 
 		 120 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  79.83 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  64.17 
 
 		 121 aa  159  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  159  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  159  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  57.38 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  57.5 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23550  SSU ribosomal protein S13P  57.38 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 125 aa  147  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>