More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1214 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  88.1 
 
 		 126 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  87.3 
 
 		 126 aa  222  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  84.13 
 
 		 126 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  79.37 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  78.57 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  81.15 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23550  SSU ribosomal protein S13P  80.33 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  80 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  79.51 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  74.6 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  78.69 
 
 		 124 aa  198  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  74.6 
 
 		 126 aa  197  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  75.2 
 
 		 125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  77.87 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  76.23 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0331  30S ribosomal protein S13  80.16 
 
 		 126 aa  193  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13028  decreased coverage  0.000403081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1115  30S ribosomal protein S13  80.95 
 
 		 126 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  72.36 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  71.79 
 
 		 126 aa  179  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  71.79 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  70.94 
 
 		 126 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  73.5 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  68 
 
 		 125 aa  177  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  72.65 
 
 		 126 aa  176  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  76.36 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 125 aa  170  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  73.64 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.66 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  165  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 123 aa  163  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  163  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  64.41 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  157  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  59.06 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  56.2 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.85 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>