More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6586 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  80.16 
 
 		 126 aa  207  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  81.3 
 
 		 124 aa  206  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  80.49 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  83.76 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  81.15 
 
 		 122 aa  204  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  77.78 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  78.86 
 
 		 124 aa  201  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  77.78 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  76.19 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  76 
 
 		 125 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  78.86 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  78.86 
 
 		 124 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  75.4 
 
 		 126 aa  196  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  76.42 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  74.6 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  76.42 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  75.61 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  79.84 
 
 		 125 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  71.43 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  76.07 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  73.81 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  75.41 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23550  SSU ribosomal protein S13P  72.13 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0331  30S ribosomal protein S13  77.78 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13028  decreased coverage  0.000403081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  72.36 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  70.94 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  69.23 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 125 aa  178  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  68.25 
 
 		 126 aa  176  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  65.08 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  67.2 
 
 		 125 aa  174  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 124 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1115  30S ribosomal protein S13  76.19 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  61.48 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  67.8 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 127 aa  164  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  66.36 
 
 		 126 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.98 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  59.02 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  68.18 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  58.73 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  153  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>