More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1754 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  98.36 
 
 		 122 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  91.8 
 
 		 122 aa  226  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 121 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 121 aa  218  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 121 aa  216  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  216  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 		 127 aa  209  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  84.17 
 
 		 120 aa  206  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  81.97 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 125 aa  160  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  157  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.34 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  63.87 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 127 aa  153  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.18 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  61.54 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  61.54 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  63.72 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  57.38 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2996  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  63.72 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3274  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000858241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2927  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 121 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 124 aa  141  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0299  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0085038  normal  0.0728223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0290  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  54.92 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  56.41 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  55.93 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>