More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0447 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
123 aa  239  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  83.74 
 
 
123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  82.93 
 
 
123 aa  204  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  78.86 
 
 
123 aa  200  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  79.51 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 
123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  78.05 
 
 
123 aa  194  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 
123 aa  190  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 
121 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 
121 aa  190  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  75.21 
 
 
121 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  77.05 
 
 
126 aa  187  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  70.49 
 
 
122 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  72.95 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
122 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 
122 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  73.77 
 
 
125 aa  184  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
122 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  71.54 
 
 
124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  75.41 
 
 
121 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  69.11 
 
 
123 aa  179  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 
124 aa  179  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 
122 aa  179  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
124 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  71.54 
 
 
122 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 
121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 
121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 
121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 
121 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  72.13 
 
 
125 aa  177  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 
121 aa  176  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  68.85 
 
 
122 aa  176  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
122 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
122 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 
122 aa  175  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
121 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
121 aa  174  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
124 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  73.04 
 
 
127 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 
128 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
127 aa  173  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 
128 aa  172  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 
128 aa  172  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
126 aa  170  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 
122 aa  169  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 
121 aa  169  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  68.07 
 
 
127 aa  167  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 
122 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 
122 aa  166  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  66.39 
 
 
122 aa  166  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 
122 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  64.75 
 
 
121 aa  165  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  62.3 
 
 
126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 
126 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 
126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 
121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
126 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  69.91 
 
 
126 aa  163  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  64.75 
 
 
121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  64.75 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  62.3 
 
 
125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 
123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  63.11 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  65.57 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  65.81 
 
 
118 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  71.82 
 
 
126 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  67.26 
 
 
127 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 
123 aa  161  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 
123 aa  161  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  66.67 
 
 
126 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 
122 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 
125 aa  160  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 
122 aa  160  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 
126 aa  160  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>