More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3970 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  81.82 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  167  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  159  8.000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  60.94 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 124 aa  156  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 124 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.16 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  63.56 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 120 aa  153  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  63.56 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  61.54 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  63.16 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  63.16 
 
 		 118 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  62.16 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>