More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf414 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  6.999999999999999e-64  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 124 aa  154  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  55 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03149  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0567144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03100  hypothetical protein  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0375392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4620  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000695624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3684  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000603669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3593  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00190616  normal  0.0522368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3781  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000117376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0075  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.679156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0415  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000337677  unclonable  0.000000013853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 124 aa  141  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3492  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0073  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.417836  hitchhiker  0.00000000329055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 		 123 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001720  SSU ribosomal protein S13p (S18e)  55.17 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000208001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0180  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000423158  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55.28 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  139  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0272  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0236994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0253  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  53.72 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>