More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1251 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 127 aa  253  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 125 aa  163  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.85 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  62.71 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 122 aa  157  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  62.3 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  61.86 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  61.86 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  67.48 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  61.86 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  58.54 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  56.69 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.48 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  54.47 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  59.35 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001720  SSU ribosomal protein S13p (S18e)  60 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000208001  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  59.85 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  58.27 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.06 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  55.91 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2152  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000893121  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  57.26 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>