More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0219 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
123 aa  243  9e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  87.8 
 
 
123 aa  217  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  76.42 
 
 
121 aa  190  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  73.17 
 
 
121 aa  184  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 
121 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  73.17 
 
 
121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
121 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
121 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  69.11 
 
 
121 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  176  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 
121 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  70.73 
 
 
121 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
121 aa  173  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 
121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
121 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 
122 aa  167  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  67.48 
 
 
122 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
121 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  59.84 
 
 
121 aa  161  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 
123 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
121 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 
121 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  68.14 
 
 
115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 
122 aa  159  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 
122 aa  159  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  65.04 
 
 
122 aa  159  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 
121 aa  159  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  64.75 
 
 
123 aa  159  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 
122 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 
123 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 
122 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.6 
 
 
122 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.54 
 
 
123 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 
122 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 
123 aa  154  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
132 aa  152  1e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 
122 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
122 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
122 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  60.98 
 
 
125 aa  152  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
126 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  60.16 
 
 
125 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
121 aa  150  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
122 aa  150  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 
124 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  60.16 
 
 
125 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
124 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
124 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  57.72 
 
 
121 aa  149  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 
125 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
124 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
124 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
126 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
122 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 
122 aa  147  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
124 aa  147  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
126 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.35 
 
 
122 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
126 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  56.91 
 
 
123 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  61.95 
 
 
114 aa  146  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  56.1 
 
 
122 aa  146  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
123 aa  146  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 
123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
121 aa  144  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  59.66 
 
 
122 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  57.72 
 
 
125 aa  143  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  57.98 
 
 
128 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  57.98 
 
 
128 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
122 aa  143  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  57.72 
 
 
124 aa  143  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 
124 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  54.47 
 
 
121 aa  143  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.06 
 
 
127 aa  141  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 
122 aa  141  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
127 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 
125 aa  141  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  58.47 
 
 
118 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  56.91 
 
 
122 aa  141  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>